环境监测是以掌握环境质量状况、变化规律及发展趋势为目的存在的，而环境监测管理目的是以质量和效率为中心深入研究其监测活动规律，实现环境监测整个系统的科学管理，保证环境监测为环境管理服好务。目前我国环境监测管理可分为两部分，一是监测管理，二是非监测管理。监测管理即监测业务领域的管理，非监测管理包括人事管理、财务管理、党团组织管理等。ISO9000（2000版）定义“质量管理体系”为实施质量管理所需的组织结构、程序、过程和资源。即把所有与质量有关的要素都纳入质量管理范畴，包括实验室的组织、与数据质量有关的布点、采样、测试、数据处理和综合评价等各个环节。因而监测管理实际上就是监测质量管理。环境监测的任何一个环节都有其特定的目的，对环境监测的总体质量有着一份“贡献”，对环境监测实行的质量管理必须是全过程的质量管理。在环境环境监测的管理工作中，充分认识和运用整体性是至关重要的。环境质量从概念上来说，决不是某个环境要素的简单加合，而是有联系的各环境要素的关系的总和。任何某一过程的质量控制都不能取代全过程的质量保证工作。